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高峰 教授 个人主页

 行政职务 无
 联系电话 +86-22-27402697
 电子邮箱 fgao@tju.edu.cn
 办公地址 天津大学北洋园校区32号楼130房间
 专业方向 生物物理学
 主讲课程 《大学物理》、《生物物理导论》、《生物信息学导论》(研究生)
 通讯地址 天津大学理学院物理系
 邮政编码 300072

个人经历或学术经历

学习经历

1997年9月~2001年7月 天津大学理学院应用物理专业 本科
2001年9月~2004年3月 天津大学理学院生物物理专业 硕士 导师:张春霆院士
2004年3月~2007年3月 天津大学理学院生物物理专业 博士 导师:张春霆院士

工作经历

2007年4月~2009年6月 天津大学理学院应用物理系 讲师
2009年7月~2015年6月 天津大学理学院应用物理系 副教授
2015年7月~至今 天津大学理学院应用物理系 教授

研究方向

申请人主要从事微生物生物信息学与合成生物学研究,已在Science等刊物发表SCI论文43篇,累计影响因子225,获Google Scholar 1025 次引用(SCI引用680次,SCI他引590次)。其中,在国际知名学术刊物 (包括 PNAS, Nucleic Acids Research, Bioinformatics 等杂志) 上发表第一作者(通讯作者)SCI论文31篇, SCI引用510次,被Science,Nature,Nature Biotechnology 等杂志SCI他引440次,7篇SCI他引大于30次(最高SCI引用101次),并被35本国际英文书籍所引用。作为第一作者为Humana Press 出版的Gene Essentiality: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology 知名系列丛书) 撰写一个章节,作为客座主编出版专刊书籍 DNA Replication Origins in Microbial Genomes (ISBN 978-2-88919-779-8)。从2007年参加工作起一直从事基因组复制起始点的相关研究,作为项目负责人已连续四次获得国家自然科学基金项目资助,研究成果获Science等期刊论文印证。

科研项目、成果专利

正在承担项目: 

1. 主持国家自然科学基金(面上基金),项目名称为“酿酒酵母全基因组复制起始点的系统化分析及识别”(项目编号:31571358),资助经费57万元(直接经费),执行期限为2016.1-2019.12,负责人。



已完成项目:

1. 主持国家自然科学基金(科学部主任基金),项目名称为“真核生物全基因组范围复制起始点的预测”(项目编号:10747150),资助经费2万元,执行期限为2008.1-2008.12,负责人,已结题。
2. 主持国家自然科学基金(青年基金),项目名称为“微生物基因组复制起始区的系统化识别及功能性分析”(项目编号:30800642),资助经费16万元,执行期限为2009.1-2011.12,负责人,已结题。
3. 主持国家自然科学基金(面上基金),项目名称为“上千种细菌基因组复制起始区的规律提取及应用”(项目编号:31171238),资助经费60万元,执行期限为2012.1-2015.12,负责人。
4. 主持教育部新世纪优秀人才支持计划项目(项目编号:NCET-12-0396),资助经费50 万元,执行期限为2013.1-2015.12,负责人。
5. 参加国家自然基金(重大研究项目),项目名称为“人与其它高等真核生物全基因组中的Isochore结构研究” (项目编号:90408028),资助经费40万元,执行期限为2005.1-2007.12,主要参与人,已结题。

论文专著

ResearcherID URL: http://www.researcherid.com/rid/C-9913-2009
ORCID: http://orcid.org/0000-0002-9563-3841
Google scholar http://scholar.google.com/citations?user=_jqaatIAAAAJ&hl=en

近五年发表的主要论著目录(第一或通讯作者)

1 W. Wei#, F. Gao#, M.Z. Du, H.L. Hua, J. Wang and F.B. Guo* (2017). Zisland Explorer: detect genomic islands by combining homogeneity and heterogeneity properties. Briefings in bioinformatics 18 (3), 357-366 (# These authors contributed equally to this work.)
2 G. Zhang, F. Gao * (2017) Quantitative analysis of correlation between AT and GC biases among bacterial genomes. PLoS ONE, 12(2): e0171408.
3 N. Jia, M.Z. Ding*, H. Luo, F. Gao* and Y.J. Yuan (2017) Complete genome sequencing and antibiotics biosynthesis pathways analysis of Streptomyces lydicus 103. Scientific Reports, 7, 44786
4 N. Jia, M.Z. Ding*, Y. Zou, F. Gao* and Y.J. Yuan (2017) Comparative genomics and metabolomics analyses of the adaptation mechanism in Ketogulonicigenium vulgare-Bacillus thuringiensis consortium. Scientific Reports, 7, 46759
5 N. Jia, M.Z. Ding*, Y.Z. Du, S. Feng, F. Gao* and Y.J. Yuan (2016). Complete Genome Sequence of the Industrial Bacterium Ketogulonicigenium vulgare SKV. Genome Announc, 4 (6), e01426-16.
6 N. Jia, M.Z. Ding*, F. Gao* and Y.J. Yuan (2016). Comparative genomics analysis of the companion mechanisms of Bacillus thuringiensis Bc601 and Bacillus endophyticus Hbe603 in bacterial consortium. Scientific Reports, 6, 28794.
7 F. Gao* (2016). Editorial: DNA Replication Originsin Microbial Genomes. Frontiers in Microbiology, 6, 1545.
8 N. Jia, M.Z. Ding*, J. Du, C.H. Pan, G. Tian, J.D. Lang, J.H. Fang, F. Gao*, Y.J. Yuan (2016). Insights into mutualism mechanism and versatile metabolism of Ketogulonicigenium vulgare Hbe602 based on comparative genomics and metabolomics studies. Sci. Rep, 6, 23068.
9 H. Huang, C.C. Song, Z. Yang, Y. Dong, Y. Hu and F. Gao* (2015).Identification of the replication origins from Cyanothece ATCC 51142 and their interactions with the DnaA protein: from in silico to in vitro studies. Frontiers in Microbiology, 6, 1370.
10 N. Jia, J. Du, M. Z. Ding, F. Gao* and Y. J. Yuan* (2015). Genome Sequence of Bacillus endophyticus and Analysis of Its Companion Mechanism in the Ketogulonigenium vulgare-Bacillus Strain Consortium. PLoS ONE , 10(8), e0135104.
11 X. Zhang, C. Peng, G. Zhang, F. Gao* (2015). Comparative analysis of essential genes in prokaryotic genomic islands. Scientific Reports, 5, 12561.
12 F. Gao, H. Luo, Z. Fu, C. T. Zhang, and R. Zhang* (2015). Exome sequencing identifies novel ApoB loss-of-function mutations causing hypobetalipoproteinemia in type 1 diabetes.Acta diabetologica, 52(3), 531-537.
13 F. Gao *(2015). Bacteria may have multiple replication origins. Frontiers in Microbiology,6, 324.
14 C. Peng, H. Luo, X. Zhang and F. Gao* (2015). Recent advances in the genome-wide study of DNA replication origins in yeast. Frontiers in Microbiology, 6, 117.
15 H. Luo, C.T. Zhang* and F. Gao* (2014). Ori-Finder 2, an integrated tool to predict replication origins in the archaeal genomes. Frontiters in Microbiology. 5, 482
16 C. Peng and F. Gao* (2014). Protein localization analysis of essential genes in prokaryotes. Scientific Reports, 4, 6001.
17 F. Gao* (2014). Recent Advances in the Identification of Replication Origins Based on the Z-curve Method. Current Genomics, 15(2), 104-112.
18 H. Huang, Y. Dong, Z.L. Yang, H. Luo, X. Zhang, F. Gao* (2014). Complete Sequence of pABTJ2, a Plasmid from A. baumannii MDR-TJ, Carrying Many Phage-like Elements.Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 12, 172-177.
19 F. Gao*, H. Luo and C.T. Zhang* (2013). DoriC 5.0: an updated database of oriC regions in both bacterial and archaeal genomes. Nucleic Acids Research, 41, 90-93.
20 F. Gao, H. Luo and C.T. Zhang* (2012). DeOri: a database of eukaryotic DNA replication origins. Bioinformatics, 28, 1551-1552.
21 H. Huang, Z.L. Yang, X.M. Wu, Y. Wang, Y.J. Liu, H. Luo, X. Lv, Y.R. Gan, S.D. Song and F. Gao* (2012). Complete genome sequence of Acinetobacter baumannii MDR-TJ and insights into its mechanism of antibiotic resistance. The Journal of antimicrobial chemotherapy, 67, 2825-2832.
22 F. Gao#, Y. Lin# and R.R. Zhang (2012). RNA-DNA differences are rarer in proto-oncogenes than in tumor suppressor genes. Scientific Reports, 2, 245. (# These authors contributed equally to this work.)
书籍
1 F. Gao, H. Luo, C.T. Zhang and R. Zhang (2015). Book chapter: "Gene Essentiality Analysis Based on DEG 10, an Updated Database of Essential Genes." Methods in Molecular Biology, Editor: Long Jason Lu, Springer
2 F. Gao, ed. (2016). DNA Replication Origins in Microbial Genomes. Lausanne: Frontiers Media, doi: 10.3389/978-2-88919-779-8 .

奖励、荣誉和学术兼职

曾获中国青少年科技创新奖,全国优秀博士学位论文提名奖,受苏黎世联邦理工学院教授 Ruedi Aebersold 和美国国立人类基因组研究所主任Eric Green 邀请加入 Faculty of 1000 (F1000Prime: FACULTY MEMBER),入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”,“天津市131创新型人才培养工程”(第二层次人选) 和天津大学“北洋青年学者计划”。担任 Frontiers in Microbiology 杂志(SCI二区刊物,影响因子4.165)副主编,Scientific Reports (SCI二区刊物,影响因子5.228),PLoS ONE (SCI三区刊物,影响因子3.057), Genomics Proteomics & Bioinformatics 杂志编委,Briefings in Bioinformatics (SCI一区刊物,影响因子8.399;主持专刊“微生物基因组与功能基因组软件及数据库最新进展”,包括美国科学院院士Eugene Koonin等本领域顶尖专家投稿十余篇和Frontiers in Microbiology 客座主编(主持专刊 DNA Replication Origins in Microbial Genomes 及其 2nd Edition)。担任了教育部科技奖励、教育部学位与研究生教育发展中心学科评估(第四轮)、国家自然科学基金通讯评审专家,国家重点研发计划生物安全重点专项预算终评专家,中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会理事,中国遗传学会生物大数据专业委员会委员,中国医药生物技术协会生物医学信息技术分委会委员,中国计算机学会计算机应用专业委员会通信委员等。担任Bioinformatics, Briefings in Bioinformatics, Journal of Antimicrobial Chemotherapy, Antimicrobial Agents and Chemotherapy 等二十余个SCI刊物的审稿人。

指导研究生情况

目前指导博士生3名,硕士生3名。

天津大学生物信息中心(主页 http://tubic.tju.edu.cn)欢迎有物理学、计算机、分子生物学、数学背景的同学前来报考。

(最后更新于2017-08-15 11:03:50)